マウス細胞株認証（ショートタンデムリピート(STR)
製品情報 "マウス細胞株認証（ショートタンデムリピート(STR)"
交差汚染や誤同定が頻発していることを踏まえると、科学研究プロジェクトで使用される細胞の真正性は大きな懸念事項となっています。すべての細胞株を用いた研究のうち、約15～20％が誤同定された細胞株を用いて行われていると推定されています。 したがって、信頼性が高く再現性のある研究を行うためには、STR解析を用いて細胞株のプロファイルを特定することが不可欠である。さらに、論文の掲載に際して細胞株の検証を要求する学術誌も増加している。
当社のサービス内容
- 細胞株の真正性確認
- オンラインデータベースとの照合
- 論文掲載可能な分析レポート
使いやすい
- 「細胞株認証依頼書」をダウンロードし、記入・印刷したものをサンプル発送物に同封してください。
- サンプルは、緩衝材入りの封筒に入れ、室温で弊社までお送りください。
- gDNA については、Tris または EDTA（10 mM Tris、0.1 mM EDTA）に溶解した 50 ng/μl の gDNA を 50 μl 以上ご提供ください。
- 細胞ペレットの場合は、100万～500万個の細胞を細胞ペレットとしてご提供ください。PBSで2回洗浄し、0.5 mlの70～90%エタノールに再懸濁してください。
マーカー
- ヒト細胞は、Promega社のPowerPlexシステムを用いて、16個のSTRマーカーによりタイピングされます。
- マウス細胞は、18 個の STR マーカーを用いてタイピングされます。
- ラットの細胞は、14個のSTRマーカーと1個の性別特異的マーカーを用いてタイピングされます。
- イヌの細胞は、11個のSTRマーカーを用いて型判定を行います。
- ハムスターの細胞は、10個のSTRマーカーを用いて型判定されます。
結果
結果は2週間以内にEメールでお知らせします。結果には、Cellosaurusデータベースとのデータ比較が含まれます。細胞株は、「認証済み」または「誤同定」に分類されます。
短鎖タンデム反復配列（STR）
2～13塩基からなり、最大で数百回繰り返されるDNAモチーフが、ショート・タンデム・リピート（STR）を構成します。STRにおける反復回数の個体差により、PCRを実施した際に生成される断片の長さにばらつきが生じます。細胞株のプロファイリングは、複数の遺伝子座におけるこれらの断片長のばらつきを用いて行われます。
細胞株混合の検出
1つの細胞株への1つまたは複数の追加細胞株による混入を、混入細胞株の頻度が10％まで低下した場合でも特定することが可能です。細胞株の組み合わせでは、通常、1つまたは複数の遺伝子座において、3つ以上のピークを持つSTRプロファイルが得られます。