Cellules NCI-H1299-RFP
1 104,00 CAD$*
Les produits sont expédiés congelés, dans de la glace carbonique, à l'intérieur de cryotubes. Chaque cryotube contient généralement 3 × 10⁶ cellules pour les lignées adhérentes ou 5 × 10⁶ cellules pour les lignées en suspension (voir le certificat d'analyse du lot pour plus de détails).
Renseignements généraux
| Description | Les cellules RFP NCI-H1299, modifiées pour intégrer un gène rapporteur dans le gène DAPK1, sont non seulement utiles pour étudier l’activation de gènes spécifiques, mais elles permettent également de mieux comprendre, d’un point de vue global, comment les cellules réagissent aux médicaments épigénétiques. En utilisant une technique appelée « analyse CAGE » (Cap Analysis of Gene Expression), les chercheurs ont pu détailler les changements dans les sites d’initiation de la transcription à l’échelle du génome en réponse à des traitements par DNMTi (DAC), HDACi (SAHA ou SB939) ou leurs combinaisons. Cette méthode révèle non seulement la réactivation attendue du gène DAPK1, mais aussi l’émergence de nouveaux sites d’initiation de la transcription, appelés TSS non annotés induits par le traitement (TINAT), en particulier sous l’effet d’un traitement médicamenteux. Ces nouveaux sites d’initiation sont généralement situés dans des régions du génome qui ne produisent habituellement pas de protéines et conduisent à la création de nouvelles molécules d’ARN susceptibles de coder pour des protéines. Une analyse plus approfondie montre que ces nouvelles molécules d’ARN peuvent parfois fusionner avec des molécules existantes pour former ce qu’on appelle des transcrits de fusion TINAT-exon. Selon la manière dont ces transcrits sont épissés, ils peuvent se traduire en nouvelles protéines atypiques. Ce processus a été confirmé par des techniques de laboratoire démontrant que ces transcrits peuvent effectivement mener à la production de nouvelles formes protéiques. Ces protéines pourraient interagir de manière anormale au sein de la cellule ou être reconnues comme étrangères par le système immunitaire, offrant ainsi potentiellement de nouvelles cibles pour le traitement du cancer. L’activation de ces TINAT implique des changements complexes tant au niveau de la méthylation de l’ADN que des modifications des histones, illustrant une interaction complexe entre ces facteurs épigénétiques sous l’effet d’un traitement médicamenteux. En particulier, l’utilisation combinée du DAC et du SB939 se révèle plus efficace, stimulant l’expression de ces nouveaux transcrits davantage que lorsque l’un ou l’autre de ces médicaments est utilisé seul. La compréhension de ces interactions et de leurs conséquences aide à clarifier comment les thérapies épigénétiques modifient le comportement cellulaire et ouvre la voie à de nouveaux traitements anticancéreux tirant parti de ces changements moléculaires complexes. |
|---|---|
| Organisme | Humain |
| Tissu | Poumon |
| Maladie | Carcinome à grandes cellules |
| Site métastatique | Site de la tumeur primaire (poumon) |
| Applications | Recherche en thérapie épigénétique; réactivation du gène DAPK1; études sur la réponse aux médicaments DNMTi et HDACi; sites de début de transcription non annotés induits par le traitement (TINAT); transcriptomique CAGE; analyse des transcrits de fusion; production de protéines atypiques à partir de promoteurs cryptiques; criblage de combinaisons de médicaments épigénétiques |
Caractéristiques
| Morphologie | De type épithélial |
|---|---|
| Type de cellule | Cellules épithéliales |
| Propriétés de croissance | Adepte |
Données réglementaires
| Référence | NCI-H1299-EGFP, avec résistance au G418 et gène rapporteur désactivé (DKFZ n° P-1045) (numéro de catalogue Cytion 300272) |
|---|---|
| Niveau de biosécurité | 1 |
| NCBI_Numéro d'identification fiscale | 9606 |
| Cellosaurus - Numéro d'enregistrement | CVCL_XB25 |
| Statut OGM | GMO-S1 : Ce dérivé de la lignée NCI-H1299 (DKFZ #P-1045) contient un rapporteur EGFP silencieux de manière stable au locus DAPK1, permettant la mesure de la réactivation épigénétique. Cassette de résistance au G418 présente. Cette classification ne s’applique qu’en Allemagne et peut différer ailleurs. |
Données biomoléculaires
Manipulation
| Milieu de culture | RPMI 1640, contenant 2,0 mM de glutamine stable et 2,0 g/L de NaHCO₃ (numéro d'article Cytion 820700a) |
|---|---|
| Suppléments | Ajouter 10 % de FBS au milieu de culture |
| Réactif de dissociation | Accutase |
| Temps de doublement | environ 24 à 36 heures |
| Repiquage | Retirez l’ancien milieu des cellules adhérentes et lavez-les avec du PBS sans calcium ni magnésium. Pour les flacons T25, utilisez 3 à 5 ml de PBS, et pour les flacons T75, utilisez 5 à 10 ml. Ensuite, recouvrez complètement les cellules d’Accutase, en utilisant 1 à 2 ml pour les flacons T25 et 2,5 ml pour les flacons T75. Laissez les cellules incuber à température ambiante pendant 8 à 10 minutes afin de les détacher. Après l’incubation, mélangez délicatement les cellules avec 10 ml de milieu pour les remettre en suspension, puis centrifugez à 300 x g pendant 3 minutes. Éliminez le surnageant, remettez les cellules en suspension dans du milieu frais, puis transférez-les dans de nouveaux flacons contenant déjà du milieu frais. |
| Rapport de fractionnement | 1 à 5 |
| Densité de semis | de 1 à 3 × 10⁴ cellules/cm² |
| Renouvellement des fluides | 2 à 3 fois par semaine |
| Milieu de congélation | Comme milieu de cryoconservation, nous utilisons un milieu de croissance complet (contenant du sérum fœtal bovin) + 10 % de DMSO pour assurer une viabilité adéquate après décongélation, ou du CM-1 (référence Cytion 800100), qui contient des osmoprotecteurs et des stabilisateurs métaboliques optimisés pour améliorer la récupération et réduire le stress induit par la cryoconservation. |
| Décongélation et culture des cellules |
|
| Atmosphère d'incubation | 37 °C, 5 % de CO₂, atmosphère humidifiée. |
| Conditions d'expédition | Les lignées cellulaires cryoconservées sont expédiées dans de la glace sèche, dans un emballage isotherme validé contenant suffisamment de réfrigérant pour maintenir une température d’environ −78 °C pendant tout le transport. À la réception, inspectez immédiatement le conteneur et transférez sans délai les flacons dans un lieu de stockage approprié. |
| Conditions d'entreposage | Pour une conservation à long terme, placez les flacons dans de l’azote liquide en phase vapeur à une température comprise entre environ −150 et −196 °C. L’entreposage à −80 °C n’est acceptable qu’à titre d’étape intermédiaire de courte durée avant le transfert dans l’azote liquide. |
Contrôle de la qualité et analyse moléculaire
| Stérilité | La contamination par les mycoplasmes est exclue à l'aide de tests basés sur la PCR et de méthodes de détection des mycoplasmes par luminescence. Afin de s’assurer qu’il n’y a aucune contamination bactérienne, fongique ou par des levures, les cultures cellulaires font l’objet d’inspections visuelles quotidiennes. |
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