Jurkat-rakud — immunoloogia ja leukeemia uurimise kuldstandardiks olev T-rakkude mudel

Sissejuhatus

Jurkat-rakud, mida tuntakse ka sünonüümide JM, JM-Jurkat, Jurkat-FHCRC, FHCRC-11 ja FCCH1024 all, on üks biomeditsiinilises uurimistöös kõige laialdasemalt kasutatavaid inimese T-rakuliine. See liin loodi 1970. aastate keskel lapsepõlves T-rakulise ägeda lümfoblastilise leukeemiaga (mida klassifitseeritakse ka eelrakk-T-rakulise ägeda lümfoblastilise leukeemiana) patsiendi perifeersest verest ning seda kirjeldasid esmakordselt Schneider, Schwenk ja kolleegid 1975. ja 1977. aasta märgilistes publikatsioonides. [1][2] Viie aastakümne jooksul on Jurkat-rakud muutunud asendamatuks vahendiks T-rakkude retseptori (TCR) signaalimise, apoptoosi, tsütokiinide tootmise ning T-rakkude pahaloomuliste kasvajate molekulaarbioloogia uurimisel. Nende tugev kasv suspensioonikultuuris, hästi iseloomustatud immunofenotüüp ja ulatuslik oomika-annotatsioon teevad neist nurgakiviks olevaks võrdlusmudeliks immunoloogias, onkoloogias ja ravimite väljatöötamises.

Peamised järeldused

• Jurkat-rakud (Cellosaurus, katalooginumber CVCL_0065) on perifeersest verest saadud surematu inimese T-rakkude leukeemia rakuliin.
• Need rakud ekspresseerivad pinnamarkereid CD3, CD4 ja CD45 ning neil on funktsionaalne T-rakkude retseptorikompleks.
• Selles liinis esinevad hästi iseloomustatud mutatsioonid BAX, TP53, NOTCH1, PTEN/INPP5D, MSH2, ja MSH6, mistõttu on selle mikrosatelliitide ebastabiilsuse tase kõrge (MSI-high).
• Jurkat-rakud on TCR-signaalimise uurimisel kesksel kohal ning nende abil on saavutatud suur osa praegusest arusaamast T-rakkude aktiveerimisradadest.
• Neid kasutatakse eelistatud mudelina apoptoosi uuringutes, leukeemia ravimite katsetamisel ja uue CAR-T-rakkude tehnoloogia arendamisel.
• Selle liini kohta on avalikult kättesaadavad ulatuslikud multi-oomikaandmed — sealhulgas proteoomika, fosfoproteoomika, DNA metülatsioon ja ravimite tundlikkuse profiilid.

Mis on Jurkat-rakuliin?

Jurkat saadi 14-aastase poisspatsiendi perifeersest verest, kellel oli lapsepõlve T-rakulise äge lümfoblastiline leukeemia (eelrakk-T-rakulise äge lümfoblastiline leukeemia). Selle rakuliini lõid Schneider ja Schwenk, kes kirjeldasid seda esmakordselt 1975. aastal „JM“-rakuliinina, näidates, et T-rakkude markerid ekspresseerusid kogu rakutsükli vältel. [1] Järgnev iseloomustamine kinnitas selle EBV-genoomi negatiivset staatust ja T-rakkude päritolu. [2][3] Kaplani ja Petersoni varased antigeenuuringud näitasid, et sellel rakuliinil avastatud T-rakk-lümfoomiga seotud antigeenid esinesid ka nabaväädi vere lümfotsüütidel, mis seostas selle mudeli T-rakkude füsioloogilise bioloogiaga. [4]

Immunofenotüübiliselt ekspresseerivad Jurkat-rakud CD3, CD4 ja CD45, neil on ümberkorraldatud T-rakkude retseptor ning neil puudub c-kit-i ekspressioon, mis on kooskõlas lümfoidse päritoluga. [5][6] TCR-geeni ümberkorraldusprofiil on hästi määratletud ja seda on kasutatud klonaalsuse diagnoosimisel võrdlusstandardina. [7] Tsütogeneetiliselt on see liin hüpoteetraploidsusega, millel esineb iseloomulik deleetsioon 2. kromosoomi lühikesel harul ning millel on kõrge MSI-staatus. [8] Peamiste somaatiliste mutatsioonide hulka kuuluvad funktsiooni kaotust põhjustavad mutatsioonid MSH2 (jama) ja MSH6 (raamistiku nihkumine) ja BAX, heterosügootne NOTCH1 mutatsioon, heterosügootne TP53 mõttetu mutatsioon ja biallelne inaktiveerumine INPP5D (SHIP1), mis peegeldab T-rakkude pahaloomuliste kasvajate keerukat genoomilist maastikku.

Teave rakukultuuri kohta

Jurkat-rakud – madal konfluentsus

Jurkat-rakud – kõrge konfluentsus

Jurkat-rakkude eelised

Jurkat-rakud pakuvad ainulaadselt töökindlat platvormi inimese T-rakkude bioloogia uurimiseks. Need kasvavad suspensioonis kiiresti, nende kahekordistumisaeg on 25–35 tundi, mistõttu sobivad need hästi suuremahulisteks biokeemilisteks ja funktsionaalseteks analüüsideks. See rakuliin ekspresseerib täielikku, signaaliedastusvõimelist TCR–CD3-kompleksi koos CD4-ko-retseptoriga, kajastades täpselt abistavate T-rakkude bioloogia põhilisi aspekte. Nende sobivus geneetiliseks manipuleerimiseks – mida tõendab tohutu hulk tuletatud knockout- ja reporterliine – võimaldab teadlastel üksikuid signaalikomponente täpselt analüüsida. Rakuliin on STR-profiilide abil täielikult autentifitseeritud ning on negatiivne mükoplasma ja välise viirusliku saastumise suhtes, mis tagab katsete korratavuse. [9][10]

Jurkat-rakkude kohta avalikult kättesaadavate multi-oomikaandmete ulatus on T-rakuliinide seas ainulaadne. See liin on lisatud vähirakkude entsüklopeediasse (Cancer Cell Line Encyclopedia, CCLE), LL-100 verivähi paneeli, ENCODE-projekti ja vähisõltuvuse kaardile (Cancer Dependency Map), pakkudes teadlastele genoomiüleseid geneetilisi, transkriptoomilisi, proteoomilisi ja ravimite tundlikkuse andmeid. [11][12][13] See põhjalik annotatsioon võimaldab läbi viia võrdlevaid ja integreerivaid analüüse, mis oleksid esmaste T-rakkude isolaatide puhul ebapraktilised. Lisaks muudab hästi iseloomustatud mutatsiooniline taust – sealhulgas määratletud puudujäägid PTEN/SHIP1-s ja DNA-mismatch-paranduses – Jurkat-rakud sobivaks mudeliks PI3K-Akt signaalitee deregulatsiooni ja genoomilise ebastabiilsuse samaaegseks uurimiseks. [14][15]

Uute ravimite väljatöötamisel lihtsustab suspensioonikasvatus ühendite kokkupuudet rakkudega ja proovide võtmist. Jurkat-rakud reageerivad tugevalt TCR-stimulatsioonile, tsütokiinravi ja apoptoosi soodustavatele stiimulitele, andes tsütokiinianalüüsides, voolutsütomeetrias ja eluvõimelisuse testides korratavaid ja kvantifitseeritavaid tulemusi. Nende reageerimisvõime nii klassikalistele kemoteraapiavahenditele kui ka uutele sihtotstarbelistele ravimitele on muutnud need rakud leukeemia ravimite arendamisel esmaseks sõelumisvahendiks. Nende kasutamine olulistes farmakogenoomilistes uuringutes, nagu näiteks CCLE, on veelgi kinnitanud nende prognostilist kasulikkust. [16][17]

Jurkat-rakkude piirangud

Hoolimata nende laialdasest kasutamisest esineb Jurkat-rakkudes mitmeid hästi dokumenteeritud geneetilisi kõrvalekaldeid, mis võivad eksperimentaalseid tulemusi moonutada. Kuna bialleliliste raamimuutuste tõttu puudub selles rakuliinis funktsionaalse BAX-valgu ekspressioon, on see loomulikult resistentne teatud proapoptootiliste stiimulite suhtes, mis sõltuvad sellest efektorist. [15] SHIP1 (INPP5D) biallelne inaktiveerumine ja funktsionaalse PTEN-i kadumine põhjustavad PI3K-Akt signaalitee pidevat aktiveerumist, mis võib moonutada signaalimisuuringute tulemusi. [14][18] Seetõttu peavad uurijad apoptoosi ja ellujäämise andmeid tõlgendama just nende konkreetsete puudujääkide kontekstis ning peaksid peamised tulemused valideerima primaarsetes T-rakkudes või alternatiivsetes mudelites.

See liin on MSI-kõrge, mis tuleneb homosügootsetest funktsiooni kaotust põhjustavatest mutatsioonidest mismatch-parandusgeenides MSH2 ja MSH6, mis põhjustab pikaajalise kultiveerimise käigus sekundaarsete mutatsioonide kogunemise kiiruse suurenemist. [19][20] See genoomiline ebastabiilsus tähendab, et erinevate laboratoorsete varude mutatsiooniprofiilid võivad olla üksteisest erinenud, mis rõhutab STR-profiilide abil toimuva regulaarse rakuliini autentsuse kontrollimise ja madala passaažiarvuga panganduse järgimise tähtsust. Hüpoteetraploidsed kariotüübid, ploidsuse heterogeensus ja iseloomulik kromosoomi 2p deleetsioon muudavad geenidoosi mõjude tõlgendamise veelgi keerulisemaks. [8]

Kuna Jurkat-rakud on transformeeritud vähirakuliin, ei kajasta need täielikult normaalse primaarse inimese T-lümfotsüüdi bioloogiat. Eelkõige sisaldab see liin aktiveerivaid NOTCH1 mutatsioonid ja heterosügootne TP53 mõttetu mutatsioon, mille tunnused on seotud pigem pahaloomulise muutumisega kui T-rakkude normaalse füsioloogiaga. [21][22] Seetõttu tuleks Jurkat-rakkudes saadud tulemused – eriti need, mis on seotud tsütotoksilise efektorfunktsiooni, ammendumise või diferentseerumisega – valideerida primaarsetes T-rakkude süsteemides või sobivates in vivo mudelites, enne kui tehakse translatsioonilisi järeldusi.

Jurkat-rakkude rakendused teadustöös

T-rakkude retseptori signaaliedastus ja immuunsüsteemi aktiveerimine

Jurkat-rakud on ligi viis aastakümmet olnud T-rakkude retseptori signaalimise lahtimõtestamise nurgakiviks. Abraham ja Weissi (2004) murranguline ülevaateartikkel – kõige sagedamini tsiteeritud artikkel, mis on seotud selle rakuliiniga – kirjeldas põhjalikult, kuidas Jurkat-rakkudel läbi viidud uuringud lõid TCR-signaalimise alusraamistiku. [23] See töö näitas, et Jurkat-rakudel läbi viidud katsed paljastasid Lck, ZAP-70 ja LAT rolli oluliste proksimaalsete kinaaside ja adapteritena TCR-i aktiveerumise järel – need avastused on tänapäeva immunoloogia aluseks. Peaaegu iga TCR-st NFAT/NF-κB/AP-1 signaalimistee peamine sõlmpunkt iseloomustati või valideeriti esmakordselt just selles rakuliinis. [23]

Hiljutistes uuringutes kasutatakse T-rakkude aktiveerimise uurimiseks endiselt Jurkat-rakke. Sulforafaani immunomoduleerivate omaduste uurimisel kasutati Jurkat-rakke, et näidata, et see looduslik isotiotsüanaat nõrgendab T-rakkude varajasi aktiveerumisprotsesse, sealhulgas IL-2 tootmist, CD25 induktsiooni ja tsütokiinide sekretsiooni pärast TCR-i stimuleerimist. [24] Need tulemused loovad mehhanistliku aluse toidu kaudu tarbitavate ristõieliste ühendite põletikuvastase toime jaoks. Samamoodi kasutati interleukiin-2-indutseeritava T-rakkude kinaasi (ITK) inhibiitorite uuringus Jurkat-rakke, et tõestada, et uued kovalentsed pürasoolipõhised ühendid pärsivad tugevalt TCR-stimulatsiooni järgset allavoolu fosforüleerimist ja IL-2 sekretsiooni, millel on in vivo efektiivsus hiiremudelis. [25]

Jurkat-rakke on kasutatud ka selle uurimiseks, kuidas transkriptsioonifaktorid mõjutavad T-rakkude identiteeti patoloogilistes olukordades. Uuringus, mis käsitles TCF7-defitsiiti kroonilise obstruktiivse kopsuhaiguse (KOK) seotud immuunsüsteemi häirete puhul, kasutati TCF7-knockout-Jurkat-rakke koos patsientide primaarrakkudega, et valideerida kolme geeni haigussignatuuri. TCF7-defitsiidiga Jurkat-rakkude, millel oli läbi viidud geneetiline päästmine, Western blotting kinnitas TCF7 rolli T-rakkude lümfoidsete geeniprogrammide säilitamisel. [26] Lisaks kasutati Fli-1 transkriptsioonifaktori STUB1-vahendatud ubikvitineerimist uurivates katsetes Jurkat-rakke in vitro platvormina, et iseloomustada CD4-ga seotud STUB1/Fli-1 signaalimisteed⁺ T-rakkude aktiveerumine põletiku ajal. [27]

Apoptoos ja rakkude surma mehhanismid

Jurkat-rakud on juba pikka aega olnud standardmudeliks T-rakkude apoptootiliste signaaliteede uurimisel, hoolimata nende BAX-i defitsiidist. Mitokondriaalse autofaagia regulatsiooni uurimisel kasutati CRISPR/Cas9 abil FADD-i knock-out'itud Jurkat-rakke, et näidata, et FADD reguleerib mitokondrite arvu PGC1-α-sõltuvate ja autofaagiaga seotud mehhanismide kaudu. [28] Rapamütsiiniga indutseeritud autofaagia ja klorokiiniga vahendatud inhibeerimise katsed, mida jälgiti LC3B Western blot’i ja mtCO1/β-globiini qPCR-meetodiga, kinnitasid, et FADD-l on mitofaagias reguleeriv roll, mis ei sõltu selle kanonilisest surmaretseptori funktsioonist.

Tsükliinist sõltuvate kinaaside (CDK) inhibiitorite mehhanismiliselt olulises uuringus kasutati Jurkat-rakke koos teiste leukeemia mudelitega, et tõestada, et CDK9 ja CDK12/13 — kuid mitte rakutsükliga seotud CDK-d — põhjustavad apoptoosi lühiajaliste antiapoptootiliste valkude Mcl-1 ja Bfl-1/A1 transkriptsiooni pärssimise kaudu. [29] Spetsiifilised inhibiitorid AZD4573, atuveciclib, SR4835 ja THZ531 põhjustasid Jurkat-rakkudes tugevaid apoptootilisi reaktsioone, selgitades nende kliinilise potentsiaali mehhanistlikku alust. Need tulemused selgitavad, miks RNA-polümeraasi II elongatsiooni suunatud CDK-inhibiitorid on tsütotoksilisemad kui need, mis on suunatud rakutsükli CDK-dele.

MikroRNA regulatsiooni uuringutes kasutati Jurkat-rakke, et uurida, kuidas LNA-anti-miR-92b ja LNA-anti-miR-181b mõjutavad BAX-, BCL-2- ja MCL-1-geenide ekspressiooni ägeda lümfoblastilise leukeemia korral. [30] Näidati, et looduslik alkaloid piperiin suurendab Jurkat-rakkude tundlikkust, muutes miRNA-profiile ja nihutades tasakaalu apoptoosi soodustavate BCL-2-perekonna liikmete poole. Eraldi läbivaatavas ülevaates tõsteti esile in vitro tõendeid selle kohta, et dokosaheksaeenhape (DHA) avaldab Jurkat-rakkudes annusest ja ajast sõltuvat tsütotoksilist mõju apoptoosi soodustavate signaaliteede kaudu, millel on sünergiline toime, kui seda kombineeritakse laste ALL-i raviks kasutatavate standardse kemoteraapia ravimitega. [31] Ajalooline iseloomustus kinnitas, et BAX-valgu puudumine Jurkat-rakkudes tuleneb kodeeriva mikrosatelliidi ühe aluspaari deletsioonidest, millel on funktsionaalsed tagajärjed apoptoosi vastupidavusele. [15]

Leukeemia bioloogia ja ravimite väljatöötamine

Lapsepõlve T-akuutse lümfoblastilise leukeemia (prekursor-T-rakkude ALL) mudelina on Jurkat-rakud olnud T-rakkude pahaloomuliste kasvajate molekulaarse geneetika iseloomustamisel lahutamatuks osaks. Mõjukates uuringutes on kindlaks tehtud, et enam kui 50% inimese T-ALL-juhtudest sisaldab aktiveerivaid NOTCH1-mutatsioone – see leid on kinnitatud ja täiendatud Jurkat-rakuliini ja teiste T-ALL-mudelite abil. [21] Põhjalike mutatsioonianalüüside käigus on tuvastatud sagedased muutused p53, lk 16/lk 15, PTEN, ning DNA-mismatch-parandusgeene mitmetes T-ALL-rakuliinides, sealhulgas Jurkatis, luues selle haiguse kohta üksikasjaliku genoomilise ülevaate. [32][33][34][18]

Ravimite ümberkasutamise strateegiates on uute vähivastaste ravimite hindamiseks kasutatud Jurkat-rakke koos teiste leukeemia mudelitega. Ühes hiljutises uuringus uuriti keemiliselt modifitseeritud tetratsükliini analoogide – sealhulgas COL-3, doksütsükliini ja minotsükliini – tsütotoksilist potentsiaali Jurkat-, K562- ja KG-1a-rakkudes. [35] COL-3 näitas suurimat toimejõudu ning mõjutas JAK2/STAT3 signaaliteed ja BCL-2 perekonna valke, tõestades Jurkat-rakkude kasulikkust ravimite toimemehhanismide uurimisel. Jurkat-rakke on kasutatud ka sihtotstarbeliste ravimitoimetamissüsteemide hindamiseks: anti-CD22-ScFv-ga kaetud β-tsüklodekstriini metallorgaanilise raamistikuga nanoplatvormi, mis oli laaditud daunorubitsiiniga, selektiivsust CD22-positiivsetes ja CD22-negatiivsetes (Jurkat) rakkudes, mis kinnitas sihtimissüsteemi spetsiifilisust. [36]

Suuremahulistes farmakogenoomika-algatustes on Jurkat-rakud kaasatud võrdluspaneelidesse. Vähirakuliinide entsüklopeedia (CCLE) ja sellega seotud farmakogenoomika ülevaateuuringutes on koostatud Jurkat-rakkude profiilid ravimite suhtes tundlikkuse osas sadade ühendite puhul, seostades genoomilisi omadusi ravimite mõju suhtes tundlikkusega. [11][16] Lapsepõlve ALL-i rakuliinide, sealhulgas Jurkat, integreeritud multi-oomika analüüsid tuvastasid päritoluliinist sõltuvaid seoseid ravimireaktsioonide ja uute ravimikandidaatide vahel, pakkudes raamistikku täppisraviks laste leukeemia puhul. [17] Autentsuse uuringud kinnitasid, et liin säilitab pikaajalise kultiveerimise käigus stabiilsed kasvutunnused ja geneetilised tunnusjooned. [37]

Proteoomika, glükoomika ja multi-oomika alased uuringud

Jurkat-rakud on muutunud suuremahulise proteoomika ja posttranslatsiooniliste modifikatsioonide (PTM) profiilide koostamise etaloniks. Märgilise tähtsusega kvantitatiivne atsetüloomi uuring, milles kasutati kõrglahutusega massispektromeetriat – sealhulgas Jurkat-rakke –, tuvastas 1 750 valgu puhul 3 600 lüsiini atsetüülimiskohta, paljastades, et atsetüülimine suunatakse eelkõige suurtele makromolekulaarsetele kompleksidele ning see reguleerib kaasa peamisi rakufunktsioone, sealhulgas kromatiini ümberkujundamist ja rakutsükli kulgu. [38] Samamoodi kasutati UbiSite-metoodikas Jurkat-rakke, et tuvastada üle 63 000 unikaalse ubikvitineerimiskoha 9 200 valgul, sealhulgas laialt levinud N-terminaalne ubikvitineerimine, mis aitas kaasa ubikvitiini bioloogia valdkonna arengule. [39]

Ka fosfoproteoomika alased uuringud on tuginenud suures osas Jurkat-rakkudele. Projektis „Augmented Multiple-Protease-Based Human Phosphopeptide Atlas“ kasutati Jurkat-rakke, et koostada vähem eelarvamuslik atlas, mis hõlmab 37 771 unikaalset fosfopeptiidi ja 18 430 unikaalset fosfosaiti, näidates sellega avalikult kättesaadavate andmebaaside trüpsiinipõhist eelarvamust ja mitme ensüümi kasutamise eeliseid. [40] Üheteistkümne levinud rakuliini, sealhulgas Jurkat, võrdlev proteoomianalüüs näitas, et hoolimata rakkude erinevast päritolust on proteoomi katvus üllatavalt ühtlane, kusjuures peamiste signaalvalkude puhul ilmnevad rakutüübispetsiifilised ekspressioonimustrid. [41] 949 vähirakuliini hõlmav kogu vähivormide proteoomiline kaardistamine kinnitas veelgi Jurkat’i positsiooni ravimite suhtes tundlikkuse ja vähi haavatavusega seotud valkbiomarkerite laias kontekstis. [42]

Glükomika uuringud on iseloomustanud Jurkat-rakkude membraanivalkude N-glükaani profiile, paljastades rakutüübispetsiifilisi mustreid siaalhappe sidemete ja glükosüültransferaasi ekspressiooni osas, mis eristavad Jurkat-rakke B-rakkude ja müeloidsetest rakuliinidest. [43] Valgu O-GlcNAc-modifikatsiooni põhjalikus kvantitatiivses proteoomika-uuringus kasutati Jurkat-rakke ühe kolmest inimraku mudelist, et näidata O-GlcNAc-modifikatsiooni rakutüübispetsiifilisi ja ühiseid reaktsioone N-glükosüleerimise pärssimise tingimustes, mille käigus tuvastati üle 1 000 O-GlcNAc-modifitseeritud valku. [44] 82 inimrakuliini, sealhulgas Jurkat, hõlmav dünaamiline DNA metülatsiooni profiilide analüüs tõi esile seose metülatsioonimustrite, geeniekspressiooni ja vähispetsiifiliste epigeneetiliste tunnuste vahel. [45]

CAR-T-rakkude tehnoloogia ja immunoteraapia

Jurkat-rakud on leidnud olulise rolli CAR-T-rakkude tehnoloogia ja sünteetiliste retseptorite arendamise arenevas valdkonnas. Kontseptsiooni tõestamise uuringu raames töötati välja märgistuseta kiire optiline pildistamisel põhinev (ROI) biosensor koos masinõppe analüüsiga, mis võimaldab CAR-T-rakkude otsest kvantifitseerimist täisverest, kasutades vereproovidesse lisatud Jurkat-rakke tuvastamisvõime valideerimiseks. [46] Selline lähenemisviis vastas kriitilisele kliinilisele vajadusele jälgida CAR-T-rakkude paljunemist reaalajas, ilma et sellega kaasneksid tavapäraste laborimeetoditega seotud kulud ja viivitused.

Uue põlvkonna terapeutiliste retseptorplatvormide kontekstis kasutati Jurkat-rakke peamise in vitro valideerimissüsteemina, et võrrelda Alzheimeri tõve raviks kohandatud SNIPR-, synNotch- ja TRUCK-sünteetilisi retseptoriarhitektuure. [47] Kõiki kolme platvormi ekspresseeriti Jurkat-rakkudes, kasutades amüloid-beeta-spetsiifilist sidumisdomeeni, ning retseptoripõhise transgeeni ekspressiooni kvantifitseeriti, et võrrelda nende suhtelist toimivust. Jurkat-rakud aitasid kaasa ka uue hüpotermilise säilitamisvalmistise (SUL-138) hindamisele kliinilise kvaliteediga CAR-T-rakkude toodete jaoks, kus Jurkat-rakud toimisid mudel-T-rakkude substraadina, et hinnata mitokondrite stabiilsust ja rakkude eluvõimelisust külmas säilitamise ja taassoojendamise ajal. [48]

Jurkat-rakke on kasutatud ka väikeste ekstratsellulaarsete vesikulite (sEV-de) allikana nanomeditsiini rakendustes. Jurkat-rakkudest suuruseksklusiivse kromatograafia abil eraldatud sEV-dele lisati kurkumiini ultraheli abil, et luua suukaudse lamerakk-kartsinoomi jaoks sihtotstarbeline ravimpreparaat. [49] In vitro ja in vivo katsed näitasid, et Jurkat-rakudest pärinevad sEV-d tugevdasid kurkumiini kasvajavastast toimet, mis illustreerib selle rakuliini mitmekülgsust bioloogilise materjali allikana, mis ulatub kaugemale selle klassikalisest kasutusest signaalimudelina. Rakuvaba normotermiline põrna perfusiooniplatvorm kinnitas veelgi steroidide immunosupressiooni mehhanisme, kasutades väljavoolavaid T-rakke võrdluses Jurkat-rakkude transkriptsiooniliste võrdlusväärtustega. [50]

Kokkuvõte

Jurkat-rakud (CVCL_0065) on viie aastakümne jooksul immunoloogia, onkoloogia ja molekulaarbioloogia valdkonnas tehtud murranguliste panuste kaudu teeninud endale inimese T-rakkude mudeli kuldstandardi staatuse. Alates TCR-signaalimise põhimõtte selgitamisest kuni tipptasemel CAR-T-rakkude uurimise võimaldamiseni toetab see ägedast lümfoblastilisest leukeemiast pärinev eelrakkude T-rakkude liin jätkuvalt fundamentaalse ja rakendusliku tähtsusega avastusi. Selle hästi iseloomustatud mutatsioonimaastik, ulatuslikud multi-oomika-märgendused ja sobivus geenitehnoloogiliseks töötlemiseks teevad sellest asendamatu tööriista – eeldusel, et teadlased arvestavad selle spetsiifiliste geneetiliste piirangutega. Olgu teie uurimistöö teemaks siis T-rakkude aktiveerimine, apoptoos, leukeemia ravimite suhtes tundlikkus või järgmise põlvkonna immunoteraapia, Jurkat-rakud pakuvad tõestatud ja põhjalikult valideeritud alust. Tutvuge täielike spetsifikatsioonidega, sealhulgas Jurkat E6.1 rakud teha alamkloon või esitada tellimus aadressil cytion.com.

Olulisemad väljaanded

1. Schwenk HU, Schneider U (1975) T-rakkude markerite sõltuvus lümfoblastide rakutsüklist. Blut. PMID: 1103999
2. Schneider U, Schwenk HU, Bornkamm G (1977) Ägeda lümfoblastilise leukeemia ja leukeemiliselt transformeerunud mitte-Hodgkini lümfoomiga lastelt pärinevate EBV-genoomi negatiivsete „null“- ja „T“-rakuliinide iseloomustus. International Journal of Cancer. PMID: 68013
3. Schneider U, Schwenk HU (1977) Ägeda lümfoblastilise leukeemia ja mitte-Hodgkini lümfoomiga lastelt pärast leukeemilist transformatsiooni loodud „T“- ja „mitte-T“-rakuliinide iseloomustus. Hematoloogia ja vereülekanded. PMID: 204546
4. Kaplan J, Peterson WD Jr (1976) T-rakk-lümfoomiga seotud antigeenide tuvastamine nabaväädi vere lümfotsüütidel ja fütohemaglutiniiniga stimuleeritud blastidel. Cancer Research. PMID: 1086134
5. Morita S, Tsuchiya S, Fujie H (1996) Inimese leukeemiarakkude liinide ja laste leukeemia rakkude pinnal asuvad c-kit-retseptorid: c-kit-ekspressiooni selektiivne säilimine megakarioblastilistes rakuliinides in vitro kultuuri kohanemise ajal. Leukemia. PMID: 8558913
6. Burger R, Hansen-Hagge TE, Drexler HG (1999) T-akutse lümfoblastilise leukeemia (T-ALL) rakuliinide heterogeensus: ettepanek klassifitseerimiseks immunofenotüübi ja T-rakkude retseptori uuringute alusel. Leukemia research. PMID: 9933131
7. Sandberg Y, Verhaaf B, van Gastel-Mol EJ (2007) Inimese T-rakuliinid, millel on selgelt määratletud T-raku retseptori geeni ümberkorraldused, BIOMED-2 mitmekordse polümeraasi ahelreaktsiooni torude kontrollidena. Leukemia. PMID: 17170727
8. LaGree KA, Lee AT, Stetten G (1988) Inimese Jurkat (FHCRC-11) rakuliin on ploidsuse ja rakkude suuruse poolest heterogeenne ning eritab detergendis lahustuvat DNA-d. Experimental Hematology. PMID: 3165345
9. Raimondi V, Minuzzo S, Ciminale V (2017) HTLV-1-ga nakatunud rakuliinide STR-profiilide määramine. Methods in molecular biology (Clifton, N.J.). PMID: 28357668
10. Uphoff CC, Pommerenke C, Denkmann SA (2019) Inimrakuliinide sõelumine viirusnakkuste tuvastamiseks RNA-Seq andmete analüüsi abil. PloS one. PMID: 30629668
11. Barretina J, Caponigro G, Stransky N (2012) Vähirakkude liinide entsüklopeedia võimaldab vähivastaste ravimite tundlikkuse prognoosimist. Nature. PMID: 22460905
12. Quentmeier H, Pommerenke C, Dirks WG (2019) LL-100 paneel: 100 rakuliini verivähi uuringuteks. Scientific Reports. PMID: 31160637
13. Ghandi M, Huang FW, Jané-Valbuena J (2019) Vähirakkude liinide entsüklopeedia iseloomustamine järgmise põlvkonna meetoditega. Nature. PMID: 31068700
14. Lo TC, Barnhill LM, Kim Y (2009) SHIP1-i inaktiveerumine T-rakkude ägeda lümfoblastilise leukeemia korral mutatsiooni ja ulatusliku alternatiivse splaissingu tõttu. Leukemia research. PMID: 19473701
15. Brimmell M, Mendiola R, Mangion J (1998) Inimese vereloomepõhiste pahaloomuliste kasvajate rakuliinides esinevad BAX-i raamimuutused on seotud apoptoosi vastupanu ja mikrosatelliitide ebastabiilsusega. Oncogene. PMID: 9583678
16. Iorio F, Knijnenburg TA, Vis DJ (2016) Vähktõve farmakogenoomiliste koostoimete ülevaade. Cell. PMID: 27397505
17. Leo IR, Aswad L, Stahl M (2022) Laste ägeda lümfoblastilise leukeemia rakuliinide integreeritud multi-oomika ja ravimireaktsiooni profiilide koostamine. Nature Communications. PMID: 35354797
18. Sakai A, Thieblemont C, Wellmann A (1998) PTEN-geeni muutused lümfoidsetes kasvajates. Blood. PMID: 9787181
19. Hosoya N, Hangaishi A, Ogawa S (1998) hMSH6-geeni raamimuutused inimese leukeemia rakuliinides. Japanese Journal of Cancer Research: Gann. PMID: 9510473
20. Inoue K, Kohno T, Takakura S (2000) Sagedane mikrosatelliitide ebastabiilsus ja BAX-mutatsioonid T-rakkude ägeda lümfoblastilise leukeemia rakuliinides. Leukemia Research. PMID: 10739008
21. Weng AP, Ferrando AA, Lee W (2004) NOTCH1-i aktiveerivad mutatsioonid inimese T-rakkude ägedas lümfoblastilises leukeemias. Science (New York, N.Y.). PMID: 15472075
22. Cheng J, Haas M (1990) Sagedased mutatsioonid p53 kasvajavastases geenis inimese leukeemia T-rakuliinides. Molekulaar- ja rakubioloogia. PMID: 2144611
23. Abraham RT, Weiss A (2004) Jurkat-T-rakud ja T-raku retseptori signaalimise paradigma areng. Nature Reviews: Immunology. PMID: 15057788
24. Fu Q, Gardner EM, Rockwell CE (2026) Taimne ühend sulforafaan vähendab tsütokiinide indutseerimist ja muid varajasi aktiveerumisprotsesse Jurkat-rakkudes. Toidulisandite ajakiri. PMID: 42152521
25. Ruan Z, Pan Z (2026) In vivo aktiivsust omavate pürasoolipõhiste selektiivsete kovalentsete ITK-inhibiitorite avastamine. European Journal of Medicinal Chemistry. PMID: 42224937
26. Wang Z, Yang Y, Wang L (2026) Immuunsüsteemi regulatsiooni häirete avastamine kroonilise obstruktiivse kopsuhaiguse (KOK) korral: kolme geeni signatuuri identifitseerimine ja TCF7 funktsionaalne valideerimine inimese kopsukoes ja T-lümfotsüütides. International Journal of Molecular Sciences. PMID: 42196213
27. Li P, Liu L, Wu Y (2026) STUB1-vahendatud ubikvitinatsioon reguleerib Fli-1 stabiilsust ja CD4⁺ T-rakkude aktiveerumist põletiku ajal. Molecular Medicine (Cambridge, Mass.). PMID: 42192504
28. Lin CZ, Zhu ZX, Zhong Q (2026) [FADD-i poolt reguleeritud mitokondriaalne autofaagia Jurkat-rakkudes]. Zhongguo shi yan xue ye xue za zhi. PMID: 42227456
29. Krings KS, Hatzfeld J, Weller S (2026) RNA-polümeraasi II aktiveerivate CDK9 ja CDK12/13, kuid mitte rakutsükli seisukohalt oluliste CDK-de pärssimine indutseerib apoptoosi, vähendades lühiajaliste Bcl-2-valkude Mcl1 ja Bfl1/A1 ekspressiooni. Cell death & disease. PMID: 42204137
30. Torkamani M, Forghanifard MM, Zarrinpour V (2025) LNA-anti-miR-92b, miR-181b, TNF-α ja piperiini mõju uurimine geeniekspressioonile ja rakkude eluvõimele Jurkat-rakkudes: mõju ägedale lümfoblastilisele leukeemiale. Galen medical journal. PMID: 42038900
31. Bittencourt VB, Schveitzer MC, da Costa RF (2026) Omega-3-rasvhapped laste ägeda lümfotsütaarse leukeemia korral: ülevaatlik uurimus. Clinical Nutrition ESPEN. PMID: 42107536
32. Kawamura M, Ohnishi H, Guo SX (1999) p53-, p21-, p16-, p15- ja RAS-geenide muutused laste T-rakkude ägedas lümfoblastilises leukeemias. Leukemia research. PMID: 10071127
33. Siebert R, Willers CP, Schramm A (1995) MTS1/p16- ja MTS2/p15-geenide homosügootne kadu lümfoomi ja lümfoblastilise leukeemia rakuliinides. British Journal of Haematology. PMID: 8547074
34. Borgonovo Brandter L, Heyman M, Rasool O (1996) p16INK4/p15INK4B-geeni inaktiveerumine on pahaloomulistes T-rakkude liinides sagedane nähtus. European Journal of Haematology. PMID: 8641406
35. Hassan ZM, Mamand DR, El-Gawly HW (2026) JAK/STAT3 signaalitee ja BCL-2 perekonna valkude diferentsiaalne modulatsioon tetratsükliini analoogide poolt leukeemia mudelites. Pharmaceutics. PMID: 42076067
36. Khabiri A, Rastegari B, Rafiei Dehbidi G (2026) Sihtmärgispetsiifiline daunorubitsiini nanoplatvorm, mis põhineb anti-CD22-ScFv-ga kaetud β-tsüklodekstriini metallorgaanilistel raamistikel. Ravimite manustamine. PMID: 42183612
37. Beesley AH, Palmer ML, Ford J (2006) Autentsus ja ravimresistentsus ägeda lümfoblastilise leukeemia rakuliinide valimis. British Journal of Cancer. PMID: 17117183
38. Choudhary C, Kumar C, Gnad F (2009) Lüsiini atsetüülimine mõjutab valkkomplekse ja reguleerib kaasa peamisi rakufunktsioone. Science (New York, N.Y.). PMID: 19608861
39. Akimov V, Barrio-Hernandez I, Hansen SVF (2018) UbiSite-meetod lüsiini ja N-terminaalsete ubikvitinatsioonikohtade põhjaliku kaardistamiseks. Nature Structural & Molecular Biology. PMID: 29967540
40. Giansanti P, Aye TT, van den Toorn H (2015) Täiendatud mitme proteaasi põhinev inimese fosfopeptiidide atlas. Cell Reports. PMID: 26074081
41. Geiger T, Wehner A, Schaab C (2012) Üheteistkümne levinud rakuliini võrdlev proteoomiline analüüs näitab, et enamiku valkude ekspressioon on laialt levinud, kuid varieeruv. Molecular & cellular proteomics : MCP. PMID: 22278370
42. Gonçalves E, Poulos RC, Cai Z (2022) 949 inimrakuliini hõlmav vähktõve üldine proteoomika kaart. Cancer Cell. PMID: 35839778
43. Reinke SO, Bayer M, Berger M (2012) Inimese vereloome rakuliinide rakumembraanivalkude N-glükaanide analüüs toob esile erinevusi nende struktuuris. Bioloogiline keemia. PMID: 22944676
44. Fu L, Yin K, Xu X (2026) Valgu O-GlcNAtsüülimise süstemaatiline kvantifitseerimine paljastab inimrakkudes N-glükosüülimise pärssimisele reageerimise ühised ja rakutüübispetsiifilised mustrid. Analytical Chemistry. PMID: 42153620
45. Varley KE, Gertz J, Bowling KM (2013) DNA dünaamiline metülatsioon erinevates inimrakkude liinides ja kudedes. Genome Research. PMID: 23325432
46. Yu N, Porter RM, Zhou X (2026) Masinõppel põhinev kiire optiline pildistamine märgistuseta CAR-T-rakkude tuvastamiseks täisveres. Biosensors. PMID: 42187436
47. Siebrand CJ, Mayeri Z, Brown I (2026) Aβ-le suunatud SNIPR-i, synNotch-i ja TRUCK-i in vitro võrdlus Alzheimeri tõve ravimite rakupõhise manustamise puhul. bioRxiv: bioloogia eeltrükkide server. PMID: 42146485
48. Öner A, Nooteboom N, Oosting L (2026) Uus SUL-138-d sisaldav hüpotermiline säilitamisvalmistis võimaldab kliinilise kvaliteediga CAR-T-rakkude pikaajalist hüpotermilist säilitamist. Pharmaceutics. PMID: 42076066
49. Ludwig N, Feldmann C, Spoerl S (2026) Kurkumiini rakuväliste vesikulite kaudu toimuv manustamine pärsib kasvaja progresseerumist hiirte suuõõne lamerakk-kartsinoomi puhul. Cancers. PMID: 42192945
50. Callais NA, Welch S, Rainwater RR (2026) Rakuvaba normotermiline põrna perfusioon selgitab steroidide immunosupressiooni transkriptsioonilisi ja mittetranskriptsioonilisi mehhanisme. bioRxiv: bioloogia eeltrükkide server. PMID: 42239436