Fare Hücre Hattı Kimlik Doğrulaması (Kısa Tandem Tekrar (STR))
Çapraz kontaminasyon ve yanlış tanımlamaların yaygınlığı göz önüne alındığında, bilimsel araştırma projelerinde kullanılan hücrelerin özgünlüğü önemli bir endişe kaynağıdır. Tüm hücre hattı temelli araştırmaların yaklaşık %15-20’sinde yanlış tanımlanmış hücre hatlarıyla çalışıldığı tahmin edilmektedir. Bu nedenle, STR analizi kullanılarak bir hücre hattının profilinin belirlenmesi, güvenilir ve tekrarlanabilir araştırmaların yürütülmesi açısından hayati önem taşımaktadır. Ayrıca, giderek artan sayıda dergi, bir makaleyi kabul etmeden önce hücre hattının doğrulanmasını şart koşmaktadır.
Hizmetimiz şunları içerir
- Hücre hattı doğrulama
- Çevrimiçi veritabanlarıyla karşılaştırma
- Yayına hazır analiz raporu
Kullanımı kolay
- Lütfen Hücre Hattı Doğrulama Sipariş Formunu indirin ve doldurup yazdırdığınız formu numune gönderiminize ekleyin.
- Lütfen numuneleri oda sıcaklığında yastıklı bir zarf içinde bize gönderin.
- gDNA için lütfen bize Tris veya EDTA (10 mM Tris, 0,1 mM EDTA) içinde 50 ng/μl konsantrasyonunda ≥ 50 μl gDNA sağlayın.
- Hücre Peletleri için lütfen bize 1,0-5,0 milyon hücreyi hücre peleti olarak sağlayın. Lütfen PBS ile iki kez yıkayın ve 0,5 ml %70-90 etanol içinde yeniden süspansiyon haline getirin.
Markerler
- İnsan hücreleri, 16 STR markörü kullanılarak Promega'nın PowerPlex Sistemi ile tipleştirilir.
- Fare hücreleri, 18 STR markörü kullanılarak tipleştirilir.
- Sıçan hücreleri, 14 STR markörü ve bir cinsiyete özgü markör kullanılarak tipleştirilir.
- Köpek hücreleri, 11 STR markörü kullanılarak tipleştirilir.
- Hamster hücreleri, 10 STR markörü kullanılarak tipleştirilir.
Sonuçlar
Sonuçlar 2 hafta içinde e-posta yoluyla size iletilecektir. Sonuçlar, verilerin Cellosaurus veritabanıyla karşılaştırılmasını içerir. Hücre hattı, doğrulanmış veya yanlış tanımlanmış olarak sınıflandırılacaktır.
Kısa Tandem Tekrarlar (STR'ler)
Birkaç yüz kez tekrarlanan 2-13 bazlık bir DNA motifi, kısa tandem tekrarını (STR) oluşturur. Bir STR'deki tekrar sayısındaki bireysel değişkenlik, PCR kullanıldığında üretilen fragmanların uzunluğunda farklılıklara yol açar. Hücre hatları, çeşitli lokuslardaki bu fragman uzunluğu farklılıkları kullanılarak profillenir.
Hücre Hattı Karışımlarının Tespiti
Bir hücre hattının, kontamine eden hücre hattının sıklığı %10'a kadar düşen bir veya daha fazla ek hücre hattı ile kontamine olup olmadığını tespit etmek mümkündür. Hücre hattı kombinasyonları genellikle tek veya birkaç lokus için üç veya daha fazla tepe noktası içeren STR profilleri sağlar.