Komórki Jurkat — wzorcowy model komórek T w badaniach nad immunologią i białaczką

Wprowadzenie

Komórki Jurkat, znana również pod synonimami JM, JM-Jurkat, Jurkat-FHCRC, FHCRC-11 oraz FCCH1024, stanowi jedną z najczęściej wykorzystywanych ludzkich linii komórek T w badaniach biomedycznych. Linia ta, wyhodowana w połowie lat 70. z krwi obwodowej pacjenta cierpiącego na ostrą białaczkę limfoblastyczną typu T u dzieci (klasyfikowaną również jako ostra białaczka limfoblastyczna z komórek prekursorowych typu T), została po raz pierwszy opisana przez Schneidera, Schwenka i współpracowników w przełomowych publikacjach z 1975 i 1977 roku. [1][2] W ciągu ponad pięciu dekad komórki Jurkat stały się nieodzownym narzędziem do badania sygnalizacji receptora komórek T (TCR), apoptozy, produkcji cytokin oraz biologii molekularnej nowotworów komórek T. Ich intensywny wzrost w hodowli zawiesinowej, dobrze scharakteryzowany immunofenotyp oraz obszerne adnotacje omiczne sprawiają, że stanowią one podstawowy model referencyjny w immunologii, onkologii i odkrywaniu leków.

Najważniejsze wnioski

• Komórki Jurkat (numer katalogowy Cellosaurus CVCL_0065) to nieśmiertelna linia komórek ludzkiej białaczki T-komórkowej pochodząca z krwi obwodowej.
• Wykazują obecność markerów powierzchniowych CD3, CD4 i CD45 oraz posiadają funkcjonalny kompleks receptora komórek T.
• Linia ta zawiera dobrze scharakteryzowane mutacje w BAX, TP53, NOTCH1, PTEN/INPP5D, MSH2, oraz MSH6, co oznacza, że charakteryzuje się wysokim poziomem niestabilności mikrosatelitarnej (MSI-high).
• Komórki Jurkat odgrywają kluczową rolę w badaniach nad sygnalizacją TCR i to właśnie dzięki nim uzyskano większość obecnej wiedzy na temat szlaków aktywacji komórek T.
• Służą one jako preferowany model do badań nad apoptozą, testowania leków przeciw białaczce oraz rozwoju nowej technologii komórek CAR-T.
• W odniesieniu do tej linii ogólnodostępne są obszerne dane z wielu dziedzin omiki — w tym z zakresu proteomiki, fosfoproteomiki, metylacji DNA oraz profili wrażliwości na leki.

Czym jest linia komórkowa Jurkat?

Linia Jurkat została wyhodowana z krwi obwodowej 14-letniego pacjenta płci męskiej cierpiącego na ostrą białaczkę limfoblastyczną typu T u dzieci (ostra białaczka limfoblastyczna z komórek prekursorowych typu T). Linię tę wyhodowali Schneider i Schwenk, którzy po raz pierwszy opisali ją w 1975 roku jako linię komórkową „JM”, wykazując, że markery komórek T ulegają ekspresji w całym cyklu komórkowym. [1] Dalsza charakterystyka potwierdziła brak genomu wirusa EBV oraz przynależność do linii komórek T. [2][3] Wczesne badania antygenowe przeprowadzone przez Kaplana i Petersona wykazały, że antygeny związane z chłoniakiem z komórek T, wykryte w tej linii komórkowej, występowały również w limfocytach krwi pępowinowej, co pozwoliło powiązać ten model z fizjologiczną biologią komórek T. [4]

Pod względem immunofenotypowym komórki Jurkat wykazują ekspresję markerów CD3, CD4 i CD45, charakteryzują się rearanżacją receptora komórek T oraz nie wykazują ekspresji c-kit, co jest zgodne z pochodzeniem limfoidalnym. [5][6] Profil rearanżacji genu TCR jest dobrze zdefiniowany i jest wykorzystywany jako standard odniesienia w diagnostyce klonalności. [7] Pod względem cytogenetycznym linia ta jest hipotetraploidalna, charakteryzuje się charakterystyczną delecją w krótkim ramieniu chromosomu 2 i wykazuje status MSI-high. [8] Do kluczowych mutacji somatycznych należą mutacje powodujące utratę funkcji w MSH2 (bzdury) oraz MSH6 (przesunięcie ramki odczytu) oraz BAX, heterozygotyczny NOTCH1 mutacja, heterozygotyczna TP53 mutacja bezsensowna oraz bialleliczna inaktywacja INPP5D (SHIP1), odzwierciedlający złożony krajobraz genomowy nowotworów z komórek T.

Informacje dotyczące hodowli komórkowej

Komórki Jurkat – niska gęstość pokrycia

Komórki Jurkat – wysoka konfluencja

Zalety komórek Jurkat

Komórki Jurkat stanowią wyjątkowo niezawodną platformę do badania biologii ludzkich komórek T. Rozwijają się one szybko w zawiesinie, a czas podwojenia wynosi 25–35 godzin, co sprawia, że doskonale nadają się do przeprowadzania badań biochemicznych i funkcjonalnych na dużą skalę. Linia ta wyraża kompletny, zdolny do sygnalizacji kompleks TCR–CD3 wraz z koreceptorem CD4, wiernie odzwierciedlając kluczowe aspekty biologii pomocniczych komórek T. Ich podatność na manipulacje genetyczne — o czym świadczy ogromny katalog pochodnych linii z wyłączonymi genami i linii reporterowych — pozwala badaczom na precyzyjną analizę poszczególnych elementów sygnalizacji. Linia komórkowa została w pełni zweryfikowana za pomocą profilowania STR i wykazuje brak zanieczyszczenia mykoplazmami oraz obcymi wirusami, co zapewnia powtarzalność wyników eksperymentalnych. [9][10]

Zakres publicznie dostępnych danych wieloomicznych dotyczących komórek Jurkat nie ma sobie równych wśród linii komórek T. Linia ta została uwzględniona w Cancer Cell Line Encyclopedia (CCLE), panelu nowotworów krwi LL-100, projekcie ENCODE oraz w Cancer Dependency Map, zapewniając badaczom adnotacje dotyczące całego genomu w zakresie genetyki, transkryptomiki, proteomiki oraz wrażliwości na leki. [11][12][13] Te bogate adnotacje umożliwiają przeprowadzanie analiz porównawczych i integracyjnych, które w przypadku pierwotnych izolatów komórek T byłyby niepraktyczne. Ponadto dobrze scharakteryzowane tło mutacyjne — w tym określone defekty w genach PTEN/SHIP1 oraz w naprawie niedopasowań DNA — sprawia, że komórki Jurkat stanowią podatny na badania model do jednoczesnego badania deregulacji szlaku PI3K-Akt oraz niestabilności genomowej. [14][15]

W zastosowaniach związanych z odkrywaniem leków metoda hodowli w zawiesinie ułatwia ekspozycję związków chemicznych i pobieranie próbek. Komórki Jurkat wykazują silną reakcję na stymulację TCR, działanie cytokin oraz bodźce proapoptotyczne, zapewniając powtarzalne i mierzalne wyniki w testach cytokinowych, cytometrii przepływowej oraz testach żywotności. Ich wrażliwość zarówno na klasyczne leki chemioterapeutyczne, jak i na nowe leki celowane sprawiła, że stały się one podstawowym narzędziem przesiewowym w procesie opracowywania leków przeciw białaczce. Ich wykorzystanie w przełomowych badaniach farmakogenomicznych, takich jak CCLE, dodatkowo potwierdziło ich wartość prognostyczną. [16][17]

Ograniczenia komórek Jurkat

Pomimo powszechnego stosowania komórki Jurkat charakteryzują się kilkoma dobrze udokumentowanymi aberracjami genetycznymi, które mogą utrudniać interpretację wyników eksperymentów. Linia ta nie wykazuje ekspresji funkcjonalnego białka BAX z powodu biallelicznych mutacji powodujących przesunięcie ramki odczytu, co sprawia, że jest ona z natury oporna na niektóre bodźce proapoptotyczne, których działanie zależy od tego efektora. [15] Bialleliczna inaktywacja genu SHIP1 (INPP5D) oraz utrata funkcjonalności genu PTEN powodują stałą aktywację szlaku PI3K-Akt, co może zafałszować wyniki badań nad szlakami sygnałowymi. [14][18] Badacze muszą zatem interpretować dane dotyczące apoptozy i przeżywalności w kontekście tych konkretnych niedoskonałości oraz powinni zweryfikować kluczowe wyniki na pierwotnych komórkach T lub w alternatywnych modelach.

Linia ta wykazuje wysoki poziom MSI z powodu homozygotycznych mutacji powodujących utratę funkcji w genach odpowiedzialnych za naprawę niedopasowań MSH2 oraz MSH6, co prowadzi do zwiększonego tempa gromadzenia się mutacji wtórnych w trakcie długotrwałej hodowli. [19][20] Ta niestabilność genomowa oznacza, że różne surowce laboratoryjne mogły ulec rozbieżności pod względem profili mutacyjnych, co podkreśla znaczenie regularnej autentyfikacji linii komórkowych za pomocą profilowania STR oraz przestrzegania zasad przechowywania komórek o niskiej liczbie pasażów. Kariotyp hipotetraploidalny, heterogeniczność pod względem ploidii oraz charakterystyczna delecja w regionie 2p chromosomu powodują dodatkowe utrudnienia przy interpretacji efektów dawki genowej. [8]

Jako transformowana linia komórek nowotworowych komórki Jurkat nie odzwierciedlają w pełni biologii prawidłowych pierwotnych ludzkich limfocytów T. Co istotne, linia ta zawiera czynniki aktywujące NOTCH1 mutacje oraz heterozygotyczność TP53 mutacja bezsensowna, cechy związane raczej z transformacją nowotworową niż z prawidłową fizjologią komórek T. [21][22] Wyniki uzyskane w komórkach Jurkat — zwłaszcza te dotyczące funkcji efektorowej cytotoksyczności, wyczerpania lub różnicowania — powinny zatem zostać zweryfikowane w systemach pierwotnych komórek T lub odpowiednich modelach in vivo, zanim wyciągnie się wnioski o znaczeniu translacyjnym.

Zastosowania komórek Jurkat w badaniach naukowych

Sygnalizacja poprzez receptory komórek T i aktywacja układu odpornościowego

Komórki Jurkat od prawie pięćdziesięciu lat stanowią podstawowy model służący do rozszyfrowania sygnalizacji receptora komórek T. Przełomowy artykuł przeglądowy autorstwa Abrahama i Weissa (2004) — najczęściej cytowana praca związana z tą linią komórkową — w sposób wyczerpujący opisał, w jaki sposób badania nad komórkami Jurkat pozwoliły ustalić podstawowe ramy sygnalizacji TCR. [23] Praca ta wykazała, że eksperymenty przeprowadzone na komórkach Jurkat pozwoliły odkryć rolę białek Lck, ZAP-70 i LAT jako kluczowych kinaz proksymalnych i adaptorów występujących w dalszej części szlaku sygnałowego po aktywacji TCR – odkrycia te do dziś stanowią fundament współczesnej immunologii. Praktycznie każdy główny węzeł osi sygnałowej TCR–NFAT/NF-κB/AP-1 został po raz pierwszy scharakteryzowany lub zweryfikowany w tej linii komórkowej. [23]

W najnowszych badaniach nadal wykorzystuje się komórki Jurkat do badań nad aktywacją komórek T. W badaniach nad właściwościami immunomodulującymi sulforafanu wykorzystano komórki Jurkat, aby wykazać, że ten naturalny izotiocyjanian osłabia wczesne procesy aktywacji komórek T, w tym produkcję IL-2, indukcję CD25 oraz wydzielanie cytokin po stymulacji receptora TCR. [24] Wyniki te wyjaśniają mechanizm działania przeciwzapalnego związków pochodzących z warzyw krzyżowych obecnych w diecie. Podobnie w badaniu inhibitorów kinazy komórek T indukowanej przez interleukinę-2 (ITK) wykorzystano komórki Jurkat w celu potwierdzenia, że nowe kowalencyjne związki na bazie pirazolu silnie hamują dalszą fosforylację i wydzielanie IL-2 po stymulacji TCR, wykazując skuteczność in vivo w modelu mysim. [25]

Komórki Jurkat wykorzystano również do zbadania, w jaki sposób czynniki transkrypcyjne modulują tożsamość komórek T w kontekście patologicznym. W badaniu dotyczącym niedoboru TCF7 w zaburzeniach regulacji immunologicznej związanych z przewlekłą obturacyjną chorobą płuc (POChP) wykorzystano komórki Jurkat z wyłączonym genem TCF7 wraz z pierwotnymi komórkami T pacjentów w celu potwierdzenia sygnatury chorobowej opartej na trzech genach. Analiza metodą Western blotting komórek Jurkat z niedoborem TCF7, w których przeprowadzono ratowanie genetyczne, potwierdziła rolę TCF7 w utrzymaniu programów genów limfoidalnych komórek T. [26] Ponadto w eksperymentach dotyczących ubikwitynacji czynnika transkrypcyjnego Fli-1, w której pośredniczy białko STUB1, wykorzystano komórki Jurkat jako platformę in vitro w celu scharakteryzowania osi sygnałowej STUB1/Fli-1 istotnej dla CD4⁺ Aktywacja komórek T podczas stanu zapalnego. [27]

Apoptoza i mechanizmy śmierci komórkowej

Komórki Jurkat od dawna stanowią standardowy model służący do analizy szlaków sygnałowych apoptozy w komórkach T, pomimo braku w nich białka BAX. W badaniach nad regulacją autofagii mitochondrialnej wykorzystano komórki Jurkat z wyłączonym genem FADD za pomocą CRISPR/Cas9, aby wykazać, że FADD reguluje liczbę mitochondriów poprzez mechanizmy zależne od PGC1-α i związane z autofagią. [28] Eksperymenty dotyczące autofagii indukowanej rapamycyną oraz hamowania za pośrednictwem chlorochiny, monitorowane za pomocą testu Western blot z wykorzystaniem białka LC3B oraz qPCR dla mtCO1 i β-globiny, potwierdziły, że białko FADD pełni rolę regulacyjną w mitofagii niezależnie od swojej kanonicznej funkcji receptora śmierci komórkowej.

W ważnym z punktu widzenia mechanizmów badaniach nad inhibitorami kinaz zależnych od cyklin (CDK) wykorzystano komórki Jurkat oraz inne modele białaczki, aby wykazać, że CDK9 oraz CDK12/13 — ale nie kinazy CDK związane z cyklem komórkowym — indukują apoptozę poprzez represję transkrypcji krótkotrwałych białek antyapoptotycznych Mcl-1 i Bfl-1/A1. [29] Specyficzne inhibitory AZD4573, atuveciclib, SR4835 i THZ531 wywołały silną reakcję apoptyczną w komórkach Jurkat, wskazując na mechanistyczne podstawy ich potencjału klinicznego. Wyniki te wyjaśniają, dlaczego inhibitory CDK ukierunkowane na fazę elongacji polimerazy RNA II wykazują większą cytotoksyczność niż te ukierunkowane na kinazy CDK cyklu komórkowego.

W badaniach dotyczących regulacji mikroRNA wykorzystano komórki Jurkat w celu zbadania, w jaki sposób LNA-anti-miR-92b i LNA-anti-miR-181b modulują ekspresję genów BAX, BCL-2 i MCL-1 w ostrej białaczce limfoblastycznej. [30] Wykazano, że piperyna, naturalny alkaloid, zwiększa wrażliwość komórek Jurkat poprzez zmianę profili miRNA i przesunięcie równowagi w kierunku proapoptotycznych członków rodziny BCL-2. Osobno w przeglądzie literatury podkreślono dowody in vitro wskazujące, że kwas dokozaheksaenowy (DHA) wywiera zależne od dawki i czasu działanie cytotoksyczne na komórki Jurkat poprzez szlaki proapoptotyczne, wykazując działanie synergiczne w połączeniu ze standardowymi lekami chemioterapeutycznymi stosowanymi w leczeniu ostrej białaczki limfoblastycznej (ALL) u dzieci. [31] Analiza historyczna potwierdziła, że brak białka BAX w komórkach Jurkat wynika z delecji pojedynczych zasad w mikrosatelicie kodującym, co ma funkcjonalne konsekwencje dla odporności na apoptozę. [15]

Biologia białaczki i odkrywanie leków

Komórki Jurkat, jako model dziecięcej ostrej białaczki limfoblastycznej typu T (ALL z prekursorowych komórek T), odgrywają kluczową rolę w charakterystyce genetyki molekularnej nowotworów z komórek T. W przełomowych badaniach ustalono, że ponad 50% przypadków ludzkiej T-ALL zawiera aktywujące mutacje NOTCH1; odkrycie to zostało potwierdzone i rozszerzone przy użyciu linii komórkowej Jurkat oraz innych modeli T-ALL. [21] W ramach kompleksowych analiz mutacji zidentyfikowano częste zmiany w p53, str. 16/str. 15, PTEN, a także geny odpowiedzialne za naprawę niedopasowań DNA w różnych liniach komórkowych T-ALL, w tym Jurkat, co pozwala na stworzenie szczegółowego obrazu genomowego tej choroby. [32][33][34][18]

W strategiach zmiany przeznaczenia leków wykorzystuje się komórki Jurkat wraz z innymi modelami białaczki w celu oceny nowych środków przeciwnowotworowych. W niedawnym badaniu oceniano potencjał cytotoksyczny chemicznie zmodyfikowanych analogów tetracykliny — w tym COL-3, doksycykliny i minocykliny — w komórkach Jurkat, K562 i KG-1a. [35] COL-3 wykazał najwyższą aktywność i modulował szlak JAK2/STAT3 oraz białka z rodziny BCL-2, co potwierdza przydatność komórek Jurkat w profilowaniu mechanistycznym leków. Komórki Jurkat wykorzystano ponadto do oceny systemów ukierunkowanego dostarczania leków: nanoplatformy z metalowo-organicznej struktury β-cyklodekstrynowej, ozdobionej anty-CD22-ScFv, zawierająca daunorubicynę, została poddana ocenie pod kątem selektywności w komórkach CD22-dodatnich w porównaniu z komórkami CD22-ujemnymi (Jurkat), co potwierdziło specyficzność tego układu celującego. [36]

W ramach szeroko zakrojonych inicjatyw farmakogenomicznych komórki Jurkat zostały uwzględnione w panelach referencyjnych. W ramach projektu Cancer Cell Line Encyclopedia (CCLE) oraz powiązanych badań farmakogenomicznych typu „landscape” opracowano profil wrażliwości komórek Jurkat na setki związków chemicznych, łącząc cechy genomowe z podatnością na leczenie. [11][16] Zintegrowane analizy wieloomiczne linii komórkowych ALL u dzieci, w tym linii Jurkat, pozwoliły zidentyfikować zależne od linii komórkowej korelacje między reakcją na leki a nowymi potencjalnymi środkami terapeutycznymi, tworząc ramy dla medycyny precyzyjnej w leczeniu białaczki u dzieci. [17] Badania autentyczności potwierdziły, że linia ta zachowuje stabilne cechy wzrostu i charakterystykę genetyczną podczas długotrwałej hodowli. [37]

Proteomika, glikomika i badania wieloomiczne

Komórki Jurkat stały się standardem odniesienia w proteomice na dużą skalę oraz w profilowaniu modyfikacji potranslacyjnych (PTM). W przełomowym badaniu ilościowym acetyloomu, przeprowadzonym z wykorzystaniem spektrometrii masowej o wysokiej rozdzielczości — z udziałem komórek Jurkat — zidentyfikowano 3 600 miejsc acetylacji lizyny w 1 750 białkach, wykazując, że acetylacja preferencyjnie dotyczy dużych kompleksów makrocząsteczkowych i współreguluje główne funkcje komórkowe, w tym przebudowę chromatyny i przebieg cyklu komórkowego. [38] Podobnie, w ramach metodologii UbiSite wykorzystano komórki Jurkat do zidentyfikowania ponad 63 000 unikalnych miejsc ubikwitynacji na 9 200 białkach, w tym powszechnej ubikwitynacji N-końca, co przyczyniło się do rozwoju dziedziny biologii ubikwityny. [39]

Badania z zakresu fosfoproteomiki również w znacznym stopniu opierały się na komórkach Jurkat. W ramach projektu „Augmented Multiple-Protease-Based Human Phosphopeptide Atlas” wykorzystano dane dotyczące komórek Jurkat w celu stworzenia mniej stronniczego atlasu zawierającego 37 771 unikalnych fosfopeptydów i 18 430 unikalnych miejsc fosforylacji, co pozwoliło wykazać stronniczość wynikającą z zastosowania trypsyny w publicznie dostępnych repozytoriach oraz podkreślić wartość podejść opartych na wielu enzymach. [40] Porównawcze analizy proteomiczne przeprowadzone na jedenastu popularnych liniach komórkowych, w tym Jurkat, wykazały, że pomimo odmiennego pochodzenia komórek zróżnicowanie proteomu pozostaje zaskakująco spójne, przy czym w przypadku kluczowych białek sygnałowych wyłaniają się specyficzne dla danego typu komórek wzorce ekspresji. [41] Proteomiczne mapowanie 949 linii komórkowych nowotworowych w ujęciu ogólnow nowotworowym pozwoliło jeszcze dokładniej umiejscowić linię Jurkat w szerokim kontekście biomarkerów białkowych związanych z wrażliwością na leki i podatnością nowotworów na leczenie. [42]

W ramach badań glikomicznych scharakteryzowano profile N-glikanów białek błonowych komórek Jurkat, ujawniając specyficzne dla tego typu komórek wzorce wiązania kwasu sialowego oraz ekspresji glikozylotransferaz, które odróżniają komórki Jurkat od linii komórek B i komórek szpikowych. [43] W ramach kompleksowego ilościowego badania proteomicznego dotyczącego O-GlcNAcylacji białek wykorzystano komórki Jurkat jako jeden z trzech modeli komórek ludzkich w celu wykazania specyficznych dla danego typu komórek oraz wspólnych reakcji modyfikacji O-GlcNAc w warunkach hamowania N-glikozylacji, co pozwoliło zidentyfikować ponad 1 000 białek poddanych O-GlcNAcylacji. [44] Analiza dynamicznych profili metylacji DNA w 82 ludzkich liniach komórkowych, w tym w linii Jurkat, pozwoliła na wyjaśnienie związku między wzorcami metylacji, ekspresją genów oraz specyficznymi dla nowotworów sygnaturami epigenetycznymi. [45]

Technologia komórek CAR-T i immunoterapia

Komórki Jurkat odgrywają znaczącą rolę w rozwijającej się dziedzinie technologii komórek CAR-T oraz inżynierii receptorów syntetycznych. W ramach badania potwierdzającego słuszność koncepcji opracowano bezznakowy biosensor wykorzystujący metodę szybkiego obrazowania optycznego (ROI) z analizą opartą na uczeniu maszynowym, służący do bezpośredniej kwantyfikacji komórek CAR-T w krwi pełnej, przy czym do weryfikacji skuteczności wykrywania wykorzystano próbki krwi z dodatkiem komórek Jurkat. [46] Podejście to stanowiło odpowiedź na pilną potrzebę kliniczną w zakresie monitorowania w czasie rzeczywistym proliferacji komórek CAR-T bez kosztów i opóźnień związanych z konwencjonalnymi metodami laboratoryjnymi.

W kontekście platform receptorów terapeutycznych nowej generacji komórki Jurkat posłużyły jako główny system walidacji in vitro do porównania architektur receptorów syntetycznych SNIPR, synNotch i TRUCK, dostosowanych do potrzeb leczenia choroby Alzheimera. [47] Wszystkie trzy platformy zostały wyrażone w komórkach Jurkat przy użyciu domeny wiążącej skierowanej przeciwko beta-amyloidowi, a ekspresję transgenu sterowaną przez receptor poddano kwantyfikacji w celu porównania ich względnej wydajności. Komórki Jurkat przyczyniły się również do oceny nowej formuły do konserwacji w warunkach hipotermii (SUL-138) przeznaczonej dla produktów z komórek CAR-T klasy klinicznej, gdzie komórki Jurkat posłużyły jako modelowe substraty komórek T do oceny stabilności mitochondriów i żywotności komórek podczas przechowywania w niskiej temperaturze oraz ponownego ogrzewania. [48]

Komórki Jurkat zostały ponadto wykorzystane jako źródło małych pęcherzyków pozakomórkowych (sEV) do zastosowań w nanomedycynie. Pęcherzyki sEV wyizolowane z komórek Jurkat metodą chromatografii wykluczającej zostały wypełnione kurkuminą za pomocą sonikacji w celu uzyskania preparatu terapeutycznego o ukierunkowanym działaniu przeznaczonego do leczenia raka płaskonabłonkowego jamy ustnej. [49] Badania in vitro i in vivo wykazały, że sEV pochodzące z linii Jurkat wzmacniały działanie kurkuminy w hamowaniu rozwoju nowotworów, co ilustruje wszechstronność tej linii komórkowej jako źródła materiału biologicznego wykraczającą poza jej klasyczne zastosowanie jako modelu sygnalizacji komórkowej. Bezkomórkowa platforma do normotermicznej perfuzji śledziony dodatkowo potwierdziła mechanizmy immunosupresji steroidowej, wykorzystując komórki T w wypływie w porównaniu z punktami odniesienia transkrypcji komórek Jurkat. [50]

Wnioski

Komórki Jurkat (CVCL_0065) zasłużyły sobie na miano „złotego standardu” wśród modeli ludzkich komórek T dzięki pięciu dekadom przełomowych osiągnięć w dziedzinie immunologii, onkologii i biologii molekularnej. Od wyjaśnienia podstawowego paradygmatu sygnalizacji TCR po umożliwienie prowadzenia najnowocześniejszych badań nad komórkami CAR-T – ta linia komórkowa, wyhodowana z komórek prekursorowych ostrej białaczki limfoblastycznej z komórek T, nadal stanowi podstawę odkryć o fundamentalnym i translacyjnym znaczeniu. Jej dobrze scharakteryzowany profil mutacji, obszerne adnotacje z zakresu wielu omik oraz podatność na inżynierię genetyczną sprawiają, że jest to narzędzie niezastąpione — pod warunkiem, że naukowcy uwzględnią jej specyficzne ograniczenia genetyczne. Niezależnie od tego, czy Państwa badania dotyczą aktywacji komórek T, apoptozy, wrażliwości na leki przeciwbiałaczkowe, czy też immunoterapii nowej generacji, Komórki Jurkat zapewniają sprawdzoną i rzetelnie zweryfikowaną podstawę. Zapoznaj się z pełną specyfikacją, w tym z Komórki Jurkat E6.1 utwórz podklon lub złóż zamówienie na stronie cytion.com.

Najważniejsze publikacje

1. Schwenk HU, Schneider U (1975) Zależność markera komórek T od cyklu komórkowego w limfoblastach. Blut. PMID: 1103999
2. Schneider U, Schwenk HU, Bornkamm G (1977) Charakterystyka linii komórkowych „null” i „T” bez genomu wirusa EBV, pochodzących od dzieci z ostrą białaczką limfoblastyczną oraz z chłoniakiem nie-Hodgkina ulegającym transformacji białaczkowej. International Journal of Cancer. PMID: 68013
3. Schneider U, Schwenk HU (1977) Charakterystyka linii komórkowych typu „T” i „nie-T” uzyskanych od dzieci z ostrą białaczką limfoblastyczną oraz chłoniakiem nie-Hodgkina po transformacji białaczkowej. Hematologia i transfuzja krwi. PMID: 204546
4. Kaplan J, Peterson WD Jr (1976) Wykrywanie antygenów związanych z chłoniakiem z komórek T w limfocytach krwi pępowinowej oraz w blastach stymulowanych fitohemaglutyniną. Cancer Research. PMID: 1086134
5. Morita S, Tsuchiya S, Fujie H (1996) Receptory c-kit na powierzchni komórek w ludzkich liniach komórkowych białaczki oraz w białaczce dziecięcej: selektywne zachowanie ekspresji c-kit w liniach komórkowych megakarioblastów podczas adaptacji do hodowli in vitro. Leukemia. PMID: 8558913
6. Burger R, Hansen-Hagge TE, Drexler HG (1999) Heterogeniczność linii komórkowych ostrej białaczki limfoblastycznej typu T (T-ALL): propozycja klasyfikacji na podstawie badań immunofenotypowych i badań receptorów komórek T. Leukemia research. PMID: 9933131
7. Sandberg Y, Verhaaf B, van Gastel-Mol EJ (2007) Ludzkie linie komórek T o ściśle zdefiniowanych rearanżacjach genów receptorów komórek T jako grupy kontrolne dla probówek do wielokrotnej reakcji łańcuchowej polimerazy BIOMED-2. Leukemia. PMID: 17170727
8. LaGree KA, Lee AT, Stetten G (1988) Ludzka linia komórkowa Jurkat (FHCRC-11) charakteryzuje się heterogennością pod względem ploidii i wielkości komórek oraz uwalnia DNA rozpuszczalne w detergentach. Experimental Hematology. PMID: 3165345
9. Raimondi V, Minuzzo S, Ciminale V (2017) Profilowanie STR linii komórkowych zakażonych wirusem HTLV-1. Methods in molecular biology (Clifton, N.J.). PMID: 28357668
10. Uphoff CC, Pommerenke C, Denkmann SA (2019) Badania przesiewowe ludzkich linii komórkowych pod kątem zakażeń wirusowych z wykorzystaniem analizy danych RNA-Seq. PloS one. PMID: 30629668
11. Barretina J, Caponigro G, Stransky N (2012) Encyklopedia linii komórkowych nowotworowych umożliwia tworzenie modeli prognostycznych wrażliwości na leki przeciwnowotworowe. Nature. PMID: 22460905
12. Quentmeier H, Pommerenke C, Dirks WG (2019) Panel LL-100: 100 linii komórkowych do badań nad nowotworami krwi. Scientific Reports. PMID: 31160637
13. Ghandi M, Huang FW, Jané-Valbuena J (2019) Charakterystyka Encyklopedii Linii Komórkowych Nowotworów z wykorzystaniem metod nowej generacji. Nature. PMID: 31068700
14. Lo TC, Barnhill LM, Kim Y (2009) Inaktywacja białka SHIP1 w ostrej białaczce limfoblastycznej z komórek T spowodowana mutacją i rozległym alternatywnym splicingiem. Leukemia Research. PMID: 19473701
15. Brimmell M, Mendiola R, Mangion J (1998) Mutacje typu frameshift w genie BAX w liniach komórkowych pochodzących z nowotworów krwiotwórczych u ludzi wiążą się z opornością na apoptozę i niestabilnością mikrosatelitarna. Oncogene. PMID: 9583678
16. Iorio F, Knijnenburg TA, Vis DJ (2016) Ogólny obraz interakcji farmakogenomicznych w nowotworach. Cell. PMID: 27397505
17. Leo IR, Aswad L, Stahl M (2022) Kompleksowa analiza wielomomiczna i profilowanie reakcji na leki w liniach komórkowych ostrej białaczki limfoblastycznej u dzieci. Nature Communications. PMID: 35354797
18. Sakai A, Thieblemont C, Wellmann A (1998) Zmiany w genie PTEN w nowotworach limfoidalnych. Blood. PMID: 9787181
19. Hosoya N, Hangaishi A, Ogawa S (1998) Mutacje powodujące przesunięcie ramki odczytu w genie hMSH6 w ludzkich liniach komórkowych białaczki. Japanese journal of cancer research : Gann. PMID: 9510473
20. Inoue K, Kohno T, Takakura S (2000) Częsta niestabilność mikrosatelitarna i mutacje genu BAX w liniach komórkowych ostrej białaczki limfoblastycznej z komórek T. Leukemia research. PMID: 10739008
21. Weng AP, Ferrando AA, Lee W (2004) Mutacje aktywujące gen NOTCH1 w ostrej białaczce limfoblastycznej z komórek T u ludzi. Science (Nowy Jork, N.Y.). PMID: 15472075
22. Cheng J, Haas M (1990) Częste mutacje w genie supresorowym nowotworów p53 w ludzkich liniach komórkowych białaczki T-komórkowej. Biologia molekularna i komórkowa. PMID: 2144611
23. Abraham RT, Weiss A (2004) Komórki T linii Jurkat i rozwój paradygmatu sygnalizacji receptora komórek T. Nature Reviews: Immunology. PMID: 15057788
24. Fu Q, Gardner EM, Rockwell CE (2026) Związek roślinny sulforafan osłabia indukcję cytokin i inne wczesne procesy aktywacyjne w komórkach Jurkat. Journal of dietary supplements. PMID: 42152521
25. Ruan Z, Pan Z (2026) Odkrycie selektywnych kowalencyjnych inhibitorów ITK opartych na pirazolu, wykazujących aktywność in vivo. European Journal of Medicinal Chemistry. PMID: 42224937
26. Wang Z, Yang Y, Wang L (2026) Postępujące zaburzenia regulacji immunologicznej w POChP: identyfikacja sygnatury trzech genów oraz walidacja funkcjonalna genu TCF7 w ludzkiej tkance płucnej i limfocytach T. International journal of molecular sciences. PMID: 42196213
27. Li P, Liu L, Wu Y (2026) Ubikwitynacja za pośrednictwem białka STUB1 reguluje stabilność białka Fli-1 oraz aktywację komórek T CD4⁺ podczas stanu zapalnego. Molecular medicine (Cambridge, Mass.). PMID: 42192504
28. Lin CZ, Zhu ZX, Zhong Q (2026) [Regulacja autofagii mitochondrialnej przez białko FADD w komórkach Jurkat]. Zhongguo shi yan xue ye xue za zhi. PMID: 42227456
29. Krings KS, Hatzfeld J, Weller S (2026) Hamowanie aktywnych wobec polimerazy RNA II kinaz CDK9 i CDK12/13, ale nie kinaz CDK związanych z cyklem komórkowym, wywołuje apoptozę poprzez obniżenie ekspresji krótkotrwałych białek Bcl-2: Mcl1 i Bfl1/A1. Cell death & disease. PMID: 42204137
30. Torkamani M, Forghanifard MM, Zarrinpour V (2025) Badanie wpływu LNA-anti-miR-92b, miR-181b, TNF-α i piperyny na ekspresję genów i żywotność komórek Jurkat: implikacje dla ostrej białaczki limfoblastycznej. Czasopismo medyczne „Galen”. PMID: 42038900
31. Bittencourt VB, Schveitzer MC, da Costa RF (2026) Kwasy tłuszczowe omega-3 w ostrym białaczce limfocytowej u dzieci: przegląd scopingowy. Clinical nutrition ESPEN. PMID: 42107536
32. Kawamura M, Ohnishi H, Guo SX (1999) Zmiany w genach p53, p21, p16, p15 i RAS w ostrym białaczce limfoblastycznej z komórek T u dzieci. Leukemia research. PMID: 10071127
33. Siebert R, Willers CP, Schramm A (1995) Homozygotyczna utrata genów MTS1/p16 i MTS2/p15 w liniach komórkowych chłoniaków i białaczki limfoblastycznej. British Journal of Haematology. PMID: 8547074
34. Borgonovo Brandter L, Heyman M, Rasool O (1996) Inaktywacja genów p16INK4/p15INK4B jest częstym zjawiskiem w złośliwych liniach komórek T. European Journal of Haematology. PMID: 8641406
35. Hassan ZM, Mamand DR, El-Gawly HW (2026) Zróżnicowana modulacja szlaku sygnałowego JAK/STAT3 oraz białek z rodziny BCL-2 przez analogi tetracykliny w modelach białaczki. Pharmaceutics. PMID: 42076067
36. Khabiri A, Rastegari B, Rafiei Dehbidi G (2026) Nanoplatforma z daunorubicyną o specyficznym działaniu, oparta na metalowo-organicznych strukturach ramowych β-cyklodekstryny pokrytych anty-CD22-ScFv. Therapeutic delivery. PMID: 42183612
37. Beesley AH, Palmer ML, Ford J (2006) Autentyczność i oporność na leki w grupie linii komórkowych ostrej białaczki limfoblastycznej. British Journal of Cancer. PMID: 17117183
38. Choudhary C, Kumar C, Gnad F (2009) Acetylacja lizyny oddziałuje na kompleksy białkowe i współreguluje główne funkcje komórkowe. Science (Nowy Jork, N.Y.). PMID: 19608861
39. Akimov V, Barrio-Hernandez I, Hansen SVF (2018) Metoda UbiSite służąca do kompleksowego mapowania miejsc ubikwitynacji lizyny i N-końca. Nature Structural & Molecular Biology. PMID: 29967540
40. Giansanti P, Aye TT, van den Toorn H (2015) Rozszerzony atlas fosfopeptydów ludzkich oparty na analizie wielu proteaz. Cell Reports. PMID: 26074081
41. Geiger T, Wehner A, Schaab C (2012) Porównawcza analiza proteomiczna jedenastu powszechnie stosowanych linii komórkowych wykazuje powszechną, ale zróżnicowaną ekspresję większości białek. Molecular & cellular proteomics : MCP. PMID: 22278370
42. Gonçalves E, Poulos RC, Cai Z (2022) Mapa proteomiczna obejmująca wszystkie nowotwory, oparta na 949 ludzkich liniach komórkowych. Cancer Cell. PMID: 35839778
43. Reinke SO, Bayer M, Berger M (2012) Analiza N-glikanów białek błony komórkowej pochodzących z ludzkich linii komórek krwiotwórczych ujawnia różnice w ich strukturze. Biochemia. PMID: 22944676
44. Fu L, Yin K, Xu X (2026) Systematyczna kwantyfikacja O-glcNAcylacji białek ujawnia wspólne oraz specyficzne dla danego typu komórek reakcje na hamowanie N-glikozylacji w komórkach ludzkich. Analytical Chemistry. PMID: 42153620
45. Varley KE, Gertz J, Bowling KM (2013) Dynamika metylacji DNA w różnych ludzkich liniach komórkowych i tkankach. Genome Research. PMID: 23325432
46. Yu N, Porter RM, Zhou X (2026) Szybkie obrazowanie optyczne wspomagane uczeniem maszynowym do bezznakowego wykrywania komórek CAR-T w krwi pełnej. Biosensors. PMID: 42187436
47. Siebrand CJ, Mayeri Z, Brown I (2026) Porównanie metod SNIPR, synNotch i TRUCK ukierunkowanych na Aβ w warunkach in vitro pod kątem komórkowego dostarczania leków w chorobie Alzheimera. bioRxiv: serwer preprintów z dziedziny biologii. PMID: 42146485
48. Öner A, Nooteboom N, Oosting L (2026) Nowatorska formuła do konserwacji w warunkach hipotermii zawierająca SUL-138 umożliwia długotrwałe przechowywanie komórek CAR-T klasy klinicznej w warunkach hipotermii. Pharmaceutics. PMID: 42076066
49. Ludwig N, Feldmann C, Spoerl S (2026) Dostarczanie kurkuminy za pośrednictwem pęcherzyków pozakomórkowych hamuje progresję nowotworu w mysim raku płaskonabłonkowym jamy ustnej. Cancers. PMID: 42192945
50. Callais NA, Welch S, Rainwater RR (2026) Bezkomórkowa perfuzja śledziony w temperaturze normotermicznej wyjaśnia mechanizmy transkrypcyjne i nietranskrypcyjne immunosupresji steroidowej. bioRxiv: serwer preprintów z dziedziny biologii. PMID: 42239436