Komórki HCC1588

HCC1588 to ludzka linia komórkowa raka piersi pochodząca od pacjentki z pierwotnym rakiem piersi, zaliczana do podtypu raka piersi typu podstawowego. Linia ta jest reprezentatywna dla potrójnie ujemnego raka piersi (TNBC), charakteryzującego się brakiem ekspresji receptora estrogenowego (ER) i receptora progesteronowego (PR) oraz brakiem amplifikacji genu HER2. Jako model typu podstawowego, HCC1588 wykazuje cechy molekularne związane z agresywnym zachowaniem nowotworu, w tym wysoką zdolność proliferacyjną, niestabilność genomową oraz wzbogacenie programów ekspresji genów związanych z przejściem nabłonkowo-mezenchymalnym i fenotypami podobnymi do komórek macierzystych.

Profilowanie molekularne dużych paneli linii komórkowych nowotworów wykazało, że linie komórkowe raka piersi, takie jak HCC1588, przyczyniają się do różnorodności zmian genomowych i transkryptomicznych wykorzystywanych do modelowania heterogeniczności nowotworów i odpowiedzi na leczenie. W zintegrowanych badaniach farmakogenomicznych linie komórkowe nowotworowe odzwierciedlają kluczowe zmiany onkogeniczne obserwowane w nowotworach pierwotnych i są rutynowo wykorzystywane do korelacji cech genetycznych z wrażliwością na leki w przypadku setek związków. Ponadto standardowe ramy adnotacji i uwierzytelniania podkreślają znaczenie spójnej charakterystyki molekularnej, w tym profilowania krótkich powtórzeń tandemowych i SNP, w celu zapewnienia powtarzalności i dokładnej klasyfikacji linii komórkowej w powszechnie stosowanych modelach, takich jak HCC1588.

Pod względem funkcjonalnym HCC1588 jest często wykorzystywany w badaniach nad mechanizmami progresji nowotworu, odpowiedzią na uszkodzenia DNA oraz opornością na leki chemioterapeutyczne i leki celowane w potrójnie ujemnym raku piersi. Jego fenotyp podobny do podstawowego oraz brak sygnalizacji receptorów hormonalnych sprawiają, że jest on szczególnie cenny w ocenie nowych strategii terapeutycznych ukierunkowanych na agresywne, oporne na leczenie podtypy raka piersi.