Inimese rakuliini autentimine (lühike tandemkordus (STR))
Arvestades ristsaastumise ja valesti identifitseerimise levikut, on teadusuuringutes kasutatavate rakkude autentsus oluline mureküsimus. Hinnanguliselt tehakse umbes 15–20% kogu rakuliinidel põhinevast uurimistööst valesti identifitseeritud rakuliinidega. Seetõttu on rakuliini profiili kindlaksmääramine STR-analüüsi abil otsustava tähtsusega usaldusväärsete ja korratavate uuringute läbiviimisel. Lisaks nõuab üha enam ajakirju artikli avaldamise eeltingimusena rakuliini verifitseerimist.
Meie teenus hõlmab
- Rakuliini autentsuse kontroll
- Võrdlus veebipõhiste andmebaasidega
- Avaldamiseks valmis analüüsiaruanne
Lihtne kasutada
- Palun laadige alla rakuliini autentimise tellimisvorm ning lisage täidetud ja väljaprinditud leht oma proovisaadetisele.
- Palun saatke proovid meile polsterdatud ümbrikus toatemperatuuril.
- gDNA puhul palun saatke meile ≥ 50 μl 50 ng/μl gDNA-d Tris- või EDTA-lahuses (10 mM Tris, 0,1 mM EDTA).
- Rakupelletite puhul palun saatke meile 1,0–5,0 miljonit rakku rakupelletina. Palun peske kaks korda PBS-ga ja suspendeerige uuesti 0,5 ml 70–90% etanoolis.
Markerid
- Inimrakke tüüpitakse Promega PowerPlex süsteemiga, kasutades 16 STR-markerit.
- Hiire rakke tüüpitakse 18 STR-markeriga.
- Roti rakke tüüpitakse 14 STR-markeriga ja ühe soospetsiifilise markeriga.
- Koera rakke tüüpitakse 11 STR-markeriga.
- Hamstri rakke tüüpitakse 10 STR-markeriga.
Tulemused
Tulemused saate 2 nädala jooksul e-posti teel. Tulemused sisaldavad andmete võrdlust Cellosaurus andmebaasiga. Rakuliin klassifitseeritakse autentseeritud või valesti identifitseeritud.
Lühikesed tandemkordused (STR-id)
Lühike tandemkordus (STR) on 2–13 aluspaari pikkune DNA-motiiv, mis kordub kuni mitusada korda. Individuaalsed erinevused STR-i korduste arvus põhjustavad PCR-i kasutamisel erinevusi tekkivate fragmentide pikkuses. Rakuliinide profiilid koostatakse, kasutades neid fragmentide pikkuse erinevusi mitmes lokuses.
Rakuliinide segunemise avastamine
On võimalik tuvastada ühe rakuliini saastumist ühe või mitme täiendava rakuliiniga kuni 10% saastunud rakuliini sageduseni. Rakuliinide kombinatsioonid annavad tavaliselt STR-profiile, millel on üks või mitu lokust kolme või enama piigiga.