Humán sejtvonal-hitelesítés (rövid tandemismétlés (STR))
Tekintettel a keresztfertőzés és a téves azonosítás gyakoriságára, a tudományos kutatási projektekben felhasznált sejtek hitelessége komoly aggodalomra ad okot. Becslések szerint az összes sejtvonal-alapú kutatás mintegy 15–20%-a tévesen azonosított sejtvonalakkal dolgozik. Ezért a sejtvonal profiljának STR-elemzéssel történő meghatározása elengedhetetlen a megbízható és megismételhető kutatások elvégzéséhez. Ezen felül egyre több folyóirat követeli meg a sejtvonal hitelesítését a cikkek elfogadásának feltételeként.
Szolgáltatásunk a következőket tartalmazza
- Sejtvonal-hitelesítés
- Összehasonlítás online adatbázisokkal
- Közzétételre kész elemzési jelentés
Könnyen használható
- Kérjük, töltse le a sejtvonal-hitelesítési megrendelőlapot, és a kitöltött, kinyomtatott példányt csatolja a mintákhoz.
- Kérjük, a mintákat párnázott borítékban, szobahőmérsékleten küldje el nekünk.
- gDNA esetén kérjük, küldjön nekünk ≥ 50 μl 50 ng/μl gDNA-t Tris vagy EDTA (10 mM Tris, 0,1 mM EDTA) oldatban.
- Sejtpellet esetén kérjük, biztosítson számunkra 1,0–5,0 millió sejtet sejtpellet formájában. Kérjük, mossa le kétszer PBS-sel, majd szuszpendálja 0,5 ml 70–90%-os etanolban.
Markerek
- Az emberi sejteket a Promega PowerPlex rendszerével, 16 STR-marker segítségével tipizáljuk.
- Az egérsejteket 18 STR-markerrel tipizáljuk.
- A patkánysejteket 14 STR-marker és egy nem-specifikus marker segítségével tipizáljuk.
- A kutyasejteket 11 STR-markerrel tipizáljuk.
- A hörcsögsejtek tipizálása 10 STR-markerrel történik.
Eredmények
Az eredményeket 2 héten belül e-mailben kapja meg. Az eredmények tartalmazzák az adatok összehasonlítását a Cellosaurus adatbázissal. A sejtvonalat hitelesítettnek vagy tévesen azonosítottnak minősítik.
Rövid tandem ismétlődések (STR-ek)
A rövid tandem ismétlődéseket (STR) 2–13 bázisból álló DNS-motívumok alkotják, amelyek akár több százszor is megismétlődhetnek. Az STR-ekben az ismétlődések számának egyéni eltérései a PCR alkalmazásakor a keletkező fragmensek hosszának eltéréseihez vezetnek. A sejtvonalakat több lókuszban a fragmensek hosszának ezekkel az eltéréseivel profilozzuk.
Sejtvonal-keverékek kimutatása
Lehetséges egy sejtvonal szennyeződésének azonosítása egy vagy több további sejtvonal által, akár a szennyező sejtvonal 10%-os gyakoriságáig. A sejtvonal-kombinációk általában három vagy több csúcsot tartalmazó STR-profilokat eredményeznek egy vagy több lókusz esetében.